El Policlínico de la Capitanía del Puerto de Puno fue creado en el año 1970, teniendo la función de salvaguardar la salud del personal naval, fue remodelada el año 1988, siendo inaugurado en el mes de diciembre del año 1991. Cumple la función de velar por la salud del personal naval en Situación Militar de Actividad, Retiro y Familiares directos con derecho.